Eugenio Belloni è stato Assistente Professore di Storia Economica all’Università Commerciale Luigi Bocconi con il Magnifico Rettore Prof. Armando Sapori dal 1964 al 1973.
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Impegnato per 30 anni presso Andrea Merzario Spa, società di trasporti leader a livello europeo, ha ricoperto la carica di Amministratore Delegato dal 1977 e di Presidente Esecutivo dal 1985. Presidente della UIRR (Union International Rail Route). Dal 1980 al 1990 Amministratore Delegato di Cemat Spa.  
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In seguito, Presidente della Fondation Pegase dal 1991 al 2001, la fondazione culturale della CEE con sede presso il Parlamento Europeo a Bruxelles. Il Comitato Direttivo era composto da Commissari rappresentanti dei tre principali gruppi politici europei (PPE, S&D, ALDE). Partecipanti i 15 paesi UE e tutti i Gruppi Parlamentari.
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Eugenio Belloni è Presidente di Fondazione ResPublica dal 2000.